Informatique

Méthodes pour l’analyse bioinformatique des séquences

Organisation

Il s'agit d'une UE obligatoire du BCC 2 (bioinformatique).

Objectifs

• Mener une analyse bioinformatique complète de données de séquençage de génome, de transcriptome, de métagénomes allant de l’analyse primaire des données brutes à l’annotation fonctionnelle et structurale.
• Comprendre les méthodes bioinformatiques mises en œuvre.

Programme succinct

• Alignement de séquences, recherche d’homologie
• Assemblage et mapping
• Motifs biologiques
• Prédiction de gènes
• Comparaison de génomes
• Détection de variants
• Structures des ARN
• Métagénomique

Crédits

9 ECTS

Équipe pédagogique

Hélène Touzet (responsable)

Évaluation

Notes sur la base des projets et interrogations écrites faites durant le semestre